一个黑历史浓厚的“平凡”中学生用超能力打架把妹顺便解放日本的故事，这么好理解的东西看不懂么？
好吧不开玩笑了，lz你现在提的这四个问题基本上都是伏笔，有些现在没有给出官方解释，从某种程度上说这不算没看懂。
1、默示录病毒（简称AP）是由一块叫做“初始之石”的陨石（目前为止是这么认为的，也不排除其真相是人造物）带至地球的，此物就是被藏在秘密基地，后来被茎道取走的东西。樱满真名是第一个接触这块石头并感染病毒的人类。至于感染后所谓“蛋疼的去害人”可谈不上，一是在Lost Chrismas以前AP的危害还不被人所知，二是AP侵蚀真名导致其产生了行为怪异的第二人格。
2、能力进化原因不明，与主角取回记忆有关。
3、ユウ的动机不明，伏笔。
4、茎道视AP为促进人类进化、使新人类诞生之物，但是为何真名是“仪式”所必须的，这一点不明，伏笔。
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