PCR反应第一步DNA双链变性逐步打开，第二部退火时两个引物各自与其互补链的5‘端通过碱基互补结合，并在第三步延伸反应时在引物的3’端不断加上新的碱基从而不断向前延长。每个引物的作用都一样。用上上下游两个引物目的是为了能够专一的复制出目的基因的特定序列。如果只是其中一个引物做PCR，得到的产物长度是随机的。
