应该有赔偿.但标准和持国有土地使用证住房会有很大的差别.国有使用证的取得费用中包含了土地出让金,其中包含有征地补偿费\安置补助费\地上附着物补偿\国土收益等.在政府拆迁中会将这部门费用根据使用年限计算,而小产权房遇到补偿时只会支付征地补偿费和安置补偿费,且这个费用很大一部分要归集体经济组织所有.而房产补偿(也就是附着物补偿)适用标准也不同于国有证住房.
城中村的房产虽然是小产权，但涉及广大农民的切身利益，而且小产权房对于缓解农村住房紧张起了有益的作用。
因此，无论是拆迁还是土地征用，小产权房的补偿问题是可以与产权房同等对待的。
小产权房遇到拆迁政府应该给予补偿，但是，是补偿给集体，而不能给你，再由集体分给集体成员。
现如今的房价虽然较为平稳，但对于很多人来说依然是承担不起的压力，故而就有不少的朋友将眼光转移到了小产权房上面，但我们要知道，小产权房是不被允许上市交易的，只能在村集体之间流通
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