不是很理解你的问题。“某个窗口”是指另外一个进程而exe文件要做该进程进行操作的话你可以尝试使用钩子函数。如果“某个窗口”指该exe生成的窗口在后台一致需要运行时你可以尝试用timer，也可以在内部创建一个线程，在线程用while(true)让他持续执行。
把你的可执行文件做成动态库，然后以线程的方式注入到你需要的窗口。
