先指出用人单位有以下几处涉嫌违法：
1、1000元/月的工资有可能以低于当地最低工资标准，我不知道你是在那的，你可以去查一下。
2、《三方协议》到学生到用人单位 报到时就终止了，要签劳动合同了，有没有签？另外，劳动合同内必须约定工资标准，否则按同岗位标准计算。
2、 关于试用期约定：劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上三年以下的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同试用期不得超过六个月。劳动合同仅约定试用期或者劳动合同期限与试用期相同的，试用期不成立，该期限为劳动合同期限。
等你确认了以上几点我才好给你建议。
先照公司协商，如不成，可以到劳动局投诉。
现可以先找以前的领导说明此事，后看领导是什么说法，如果这走不通的话，那就只好打电话去询问劳动部门。。。。。。
劳动合同中关于工资的问题也是需要双方进行协商的，对于合同约定的工资，用人单位应当支付，对于合同没有约定，或者约定不明的，双方需要另行协商，你对于工资问题有意见可以向当地劳动监察大队反映问题，以求解决。
纵横法律网 余庆民律师
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