会的，把2级域名使用转向到一级域名吧。
你是新添加的频道，还是，改原来的URL地址啊，如果是新添加的频道，那么，百度会把二级域名当做一个新的域名内容来对待，而不去管其它的，如果是全部都做改变，那么，百度会重新考察一下，因为你的URL地址全部都变了，这个你需要慎重考虑一下。
这个恐怕是不可能一起收录的，至于你说的几个月的考察期恐怕也没那么长，通常一个月左右也就收录了
二级域名可以说与顶级域名关系很小，类似于另外一个网站，而二级目录就和顶级域名紧密的多，如果同时启用，SE会将其中一个的内容当做复制另一个网站的内容不予收录……话就说这么多，剩下的是你的事了
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