中国医药教育协会的业务范围是：医药教育管理、业务培训、学术交流、专业展览、书刊编辑、咨询服务、国际合作。协会涉及的主要工作领域是：高等药学教育、医药职业技术教育、药监系统和医药行业的岗位培训、医药行业继续教育、国际合作等。协会建立了全国医药教育网站，与中国药科大学，广东药学院共同主办“药学教育”杂志，并创办了“医药教育通讯”。
中国医药教育协会下已设四个专业委员会和协会秘书处、协会学术部、协会成教部、协会职教部、社区医药卫生健康促进办公室等内设机构。
中国医药教育协会自成立以来，根据协会的章程，在主管部门的指导下，积极开展工作，建立了具有特色的全国医药教育网络。成立了高等药学院校（系）委员会、职业技术教育委员会、成人教育委员会、专家委员会，这四个委员会的建成，构成了协会工作的主体，包括了高等药学教育、医药职业技术教育、医药行业职工的岗位培训和继续教育在内的医药教育部门的各个层次和专业领域。在教育层次上涉及培养从中专生到博士生的多层次各类药学专门人才，涉及培养在职的初级到高级的专业技术人员、行业管理干部，覆盖了医药教育的方方面面。
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