银行需要建档存档,没有不合理的地方,这对你其实没有任何影响。如果你需要此合同,可以到房管局的房产档案室调取一份复印件,盖上档案室的公章后视同原件,或者到房屋开发公司调取一份复印件,开发公司加盖个公章即可。
你还清了,两证在手,上面的抵押注销章盖了,就没问题了。