如果日方把【在留资格认定书】寄给你的话,说明日本入管局已经审查同意你入境了,就不需要其他的材料了。拿着护照和在留资格认定书到当地大使馆或领事馆直接办理签证即可。
大使馆不接受个人的签证申请。找你所在地区的指定代理店吧,他们会告诉你准备什么材料的。