原则上是不能的。你的FTP权限仅仅是传文件上去，或者取文件回来。
如果你的FTP可以把文件传送到任意地方，或者获取任意目录的文件，那么可以给你一个思路：就是除了传送你的安装程序以为，把安装命令写为一个命令文件，把这个命令传送到操作系统自动加载的目录，等下次重启机器的时候自动安装。
不过WINDOWS机器不好做，因为WINDOWS机器的安装程序一般都需要点鼠标，你要传那种可以解包使用，无需安装的代理服务器。在WINDOWS下，把文件存放在开始、程序、启动组里面，等那个用户登录的时候你的程序就启动了。
ftp只能上传下载文件，不能在服务器上安装文件，如果要实行安装软件，就必须借助远程控制软件来操作。
IIS7服务器管理工具可以批量管理、定时上传下载、同步操作、数据备份、到期提醒、自动更新。IIS7服务器管理工具适用于Windows操作系统和liunx操作系统；支持Ftp客户端批量操作。
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