运费发票丢失，我方已经挂账，对方单位发票丢失，现在对方不认，我方应收账款与对方对不上，

如果是货运增值税专用发票，可以向税局申请开具《已抄报税丢失证明单》并附上记账联复印件，给对方抵扣和报账用。如果是其他发票，对方可以用复印件记账。
如果是对方不认账了，那么只能是自己销账了。
会计规定做法：是通过坏账准备来核销应收账款
计提
借：管理费用
贷：坏账准备
借：坏账准备
贷：应收账款

已开具的发票丢失，，，你们就做营业外支出？指的是税费你们承担，，然后重开一张发票过去？

如果是，，你的分录是
借：营业外支出（税前不能扣除）
贷：应缴税费-应交增值税（这笔运费的税费）

如果是过了180天的认证期，，关于税费。。也只能由你们协商谁来承担了

如果是未过期。。。你们可以去税局申请开具《已抄报税丢失证明单》啊，这样，，大家都没损失

运费发票丢失，我方已经挂账，对方单位发票丢失，——可以向税局申请开具《已抄报税丢失证明单》并附上记账联复印件，给对方抵扣和报账用。如果是其他发票，对方可以用复印件记账。

现在对方不认，——可以依法解决。

现在我方领导，要求我们拿这笔运费的价格，，，借：营业外支出，贷：应收账款，可以吗？——如果放弃债权，是可以这样做的。

如果你单位执行的是小企业会计准则，则：

借：营业外支出

贷：应收账款

如果你单位执行的是企业会计准则，则需要使用备抵法来处理坏账：

是这笔钱以后都不收了，还是只是票没有了，以后再开再收款的问题