你好!看了你的描述,预备党员转正,毕业后预备党员档案,学校寄到南京市,而党员组织关系介绍信在九江,根据这种情况,需要办理程序,本人写预备党员要求转为正式党员的申请书,交给所在单位党支部,并在党支部开出证明,到上一级党委组织办公室开出调档证明,到南京市调出预备党员档案,带到九江所在党支部,这样,党支部就能按期讨论转正,完全没问题,祝好运!