根据题意，培养皿中的大肠杆菌菌落是同种生物的全部个体，属于种群．故选：B．
种群是指在一定时间内占据一定空间的同种生物的所有个体．所以培养皿中的大肠杆菌菌落，从生命系统的结构层次来分析，对应的层次是种群．故选：c．
