A、线粒体内膜向内折叠形成嵴,叶绿体类囊体堆叠形成基粒,A正确;B、叶绿体中的ATP是光合作用的光反应阶段产生的;黑暗中,不能进行光反应,无ATP的产生,B错误;C、细胞生命活动所需能量一般是由细胞质基质和线粒体提供的,叶绿体也产生的ATP,供给暗反应,C错误;D、叶绿体与光合作用有关,线粒体与有氧呼吸有关,叶绿体和线粒体基质所含酶的种类不同,D错误;故选:A