首先，三方协议是一个依照合同法签订的合同，受到合同法的规范。
第二，劳动合同是一个依照劳动合同法签订的合同，受劳动合同法的规范。
两个合同之间并没有哪个效力大的问题，签订劳动合同之后并不必然的使就业协议失效，除非是就业协议中有这样的特殊约定。
就业协议与劳动合同是两个不同的东西！
只要与用人单位签劳动合同了，就不会再有违约金了！
应该是以劳动合同为准。
同意龙图小松的回答，按照合同法和劳动法，两部法没有隶属关系
以劳动合同为准
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