我第一套房屋公积金贷款已还清有证，现在想买第二套可以用这套房子抵押贷款20万付首付吗？

你先做房产抵押贷款，先去银行并通过的评估，进行审批后，看是否能贷到20万，评估贷款额和你的房产价值有直接关系

关于你的情况，我提个二个建议，希望能对你有帮助。
一，因为政策原故二套房的利息要比抵押贷款高，所以用抵押贷款来付首付，将低利率是个很好的方法，而目前开通的抵押贷款在招商银行和中国银行。但是招商银行有规定，如果你的抵押贷款是为了购买二套房，利率要最少要上浮10%，但中国银行还是基准利率。当然我们这是这样，你最好要到你们那银行先明确利率水平
二，计算家庭人均面积，如果购房者家庭人均面积低于26.65平方，二套房贷款可以按首套贷款计算，不过并不是所有的银行都有这个政策。北京深圳的是这个，上海的是32平米，杭州的是24.3平米。你可以到银行咨询相关情况。可以去问下工行和建行。
另外我觉得贷款这事，你也最好多对比几个行吧，因为每个行的利息和优惠政策都不一样。

还有啊，你上面说你首套房用的是住房公积金贷款，而且还清是是吧？住房公积金贷款期间只能使用一次，但是还清后，还可以使用，并无二套房的概念，可以按首套房付首付。利率也稳定些。夫妻双方可申请的最高额度是60万，个人最高额度40万
只是不知道你们那边可否使用啊

要是可以的话就没问题了。

理论上可以实行。
首先你先做房产抵押贷款，先去银行并通过指定的评估公司评估，并进行审批，看是否能贷到20万，具体要看你房产价值，正常来讲，你的首套房必须评估值大于40万才可能贷到20万。
以下按等额还款法帮你计算。
年限 期数 年利率 月利率 贷款额 月供
5年 60期 6.45% 5.375‰ 200000元人民币 3908.55元人民币 5年合计234512.84
10年 120期 6.6% 5.5‰ 200000元人民币 2281.15元人民币 10年合计273737.86

然后你再购买二套房，由于是二套房，要求首付60%，（这里我就不帮你看是否能贷20万了，按20万计）贷款利率1.1倍。
年限 期数 年利率 月利率 贷款额 月供
10年 120期 7.26% 6.05‰ 200000元人民币 2349.06元人民币 10年合计281886.99
5年 60期 7.095% 5.9125‰ 200000元人民币 3969.21元人民币 5年合计238152.60
20年 240期 7.26% 6.05‰ 200000元人民币 1581.96元人民币 20年合379671.36

如果是我，我会选择抵押贷做十年，在招行做，做随还随贷，有钱时就还上，没钱时先贷。
购房贷款，我会做20年，以减少现在的还贷压力。选择等额本金法，有钱时随时做提前还款。

政策上不可行。因为新的限购令不允许买第三套住房。1套：你公积金贷款的第一套。二套：抵押贷款。三套：你新买的房。（我们天津市这样的，认房又认贷，不知道你们那怎样。）
但是理论上还是能操作的：时间差问题。只要你的抵押贷款房款后，一定要在你办理抵押贷款的银行向中行上报你的最新征信信息前，尽快办理完你第二套住房的贷款事宜。这样你的第二套住房贷款行就没法查出你已经有两笔贷款，这能看到你公积金贷款那一笔。
抵押贷款利率：基准利率上浮10%到30%看你在哪做。
二套住房利率：基准利率到上浮15%

首先现有房子最高可以贷到70％房价，需要评估；如果不在限购的范围内可以再按揭；抵押贷款目前银行需要一段时间才能拿到；可以找钱庄但利率高。