A、蓝球藻、念珠藻、颤藻和发菜都属于蓝藻，A正确；B、蓝藻细胞虽不含叶绿体，但含有叶绿素和藻蓝素，也能进行光合作用，属于自养生物，B正确；C、蓝藻是原核生物，含有核糖体一种细胞器，C错误；D、淡水水域污染、富营养化时，会长出水华，其中有多种蓝藻，D正确．故选：C．
