请问DEA中，如果输出指标，例如净利润为负数，具体用软件做效率评价时该怎么处理？

DEA的效绩指标都是大于0的结果. 如果输出为负值 最后实际效绩值有可能为负值, 但是如果用DEA是反映不出来的. 如果用DEA方法, 除非所有的DMU这项指标都是负值 不然不能进行有效的计算. (即使所有的DMU这项都是负值, 计算结果也很有问题).
如果一定要用DEA的话有这样几个方法
1.可以将净利润和其他输入或者输出项进行合并，以保证每一个数据都是大于0，再进行计算；
2.如果输出只有利润一项的话，可以将正负利润的DMU进行单独计算；在计算负利润的DMU的效绩的时候将负利润变成正值（绝对值），然后将算出的效绩值变成负值（加负号）；最后将所有的DMU的效绩值合并。 这样就可以用DEA同时反映正负效率。 但注意，这个结果是两次DEA计算合并的结果，跟DEA的基本属性相悖， 并非与每一个DMU比较得出的结果，所以 最后结果只能为排名做参考，效率数值本身没有意义。
希望对你有帮助
呵呵 以前那DEA个负相关的问题确实是我答的

用投入面的bcc模型开解，具有产出平移不变性

不对，如果出现负值 大多数DEA模型都是无解的，因为相应的CharnesCoOPER变换不成立，所以不可能将原模型转化为LP模型。比较靠谱的解决负值问题是用加法模型（additive model），因为加法模型具有平移不变性，讲通俗一点，就是对于某一输入变量X1，所有的DMU都加上或者减去同一个数，模型评价结果不变。