长期以来，港澳与祖国内地一直保持着密切的经济联系，故A叙述错误，不符合题意；港澳的发展主要靠自身优越的位置、内地的资源等，故B叙述错误，不符合题意；祖国内地主要通过香港与世界各地进行贸易往来，因为香港的维多利亚港是天然良港，故C叙述错误，不符合题意；港澳与祖国内地的经济合作是互惠互利、优势互补，故D叙述正确，符合题意．故选：D．
