A、在口腔中,唾液中只含有淀粉酶,可以将淀粉分解成麦芽糖;B、在胃中胃液只含有胃蛋白酶,可以把蛋白质分解成多肽;C、肝脏分泌胆汁,胆汁不含消化酶,只能乳化脂肪;D、在小肠内含有三种消化液,胆汁、胰液、肠液,胰液和肠液中含有能消化淀粉、蛋白质和脂肪的多种消化酶,淀粉、蛋白质、脂肪最总在小肠内被分解成葡萄糖、氨基酸、甘油和脂肪酸.综上所述,含消化酶种类最多的消化器官是小肠.故选:D.