管理科学与工程系、金融系、经济系、会计系、战略与政策系、市场营销系、人力资源与组织行为系、技术经济与管理系等8个系,在管理科学与工程、工商管理、理论经济学、应用经济学等4个一级学科均有博士点,其中工商管理、管理科学与工程、数量经济学3个学科为国家重点学科。国家重点学科点的数目在全国管理学院中是最多的。在学位与研究生教育发展中心组织的全国一级学科评估中,清华大学管理科学与工程学科整体水平排名第二,工商管理学科整体水平排名第一。清华大学MBA教育项目在全国MBA教学合格评估中排名第一。