财政直接支付程序。预算单位按照批复的部门预算和财政直接支付用款计划，在发生财政直接支付事项时提出支付申请，经以及预算单位审核后，报送财政国库支付执行机构；【财政国库支付执行机构根据批复的部门预算和用款计划及相关要求对支付申请审核无误后，向代理银行发出支付令，并通知中国人民银行国库部门；】代理银行据此通过财政零余额账户，将财政性资金直接支付到收款人或用款单位账户，并将当日实际支付资金按性质和预算科目汇总，由财政国库支付执行机构和财政总预算会计审核确认后，与中国人民银行国库部门进行资金清算。财政直接支付主要通过转账方式进行。
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