火车站确实是矩阵世界，但这个火车站并不是那一派统治人类的机器所制造的。在地球上，机器（或者说控制机器的程序）也分成好几派，其中一派并不喜欢控制人类，也不喜欢人类这个生物，它们只喜欢程序和程序在一起。这个火车站是用来迷惑其它程序的。
至于现实世界，虽然电影中没有明确点出来，但很多人（包括本人）都认为，现实世界只是另一个更大的矩阵世界而已，而这个所谓的“现实世界”究竟是谁制造出来的，谁也不知道。尼奥也许就是因为看透了这个世界的本质，人类和机器都是在一个虚拟世界中，那么人类和机器相互之间的斗殴又有什么意义呢？还不如和平共处更好，反正大家都是虚拟的，不是真的。这也解释了他为什么能够控制现实中的机械乌贼。
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