分居两年就可以申请离婚了，
你这已经三年，
直接准备证明材料申请离婚就可以。
配合法院工作就好。
此类情况，女方当事人可以作为利害关系人，到法院申请宣告男方失踪，然后在法院申请诉讼离婚。
《民法通则》：
第二十条 公民下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告他为失踪人。
战争期间下落不明的，下落不明的时间从战争结束之日起计算。
《婚姻法》：
第三十二条 男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。
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