①基因突变是不定向的，可能发生显性突变，也可以发生隐性突变，①错误；
②可以通过物理因素、化学因素、生物因素提高基因的突变频率，②正确；
③基因突变是DNA中碱基对的增添、缺少或替换从而引起基因结构的改变，叫基因突变，③错误；
④基因突变、基因重组、染色体变异中，只有基因突变能产生新的基因，④错误；
⑤基因突变的频率是很低的，⑤正确；
⑥基因突变是DNA中碱基对的增添、缺少或替换，是基因内部的化学变化，⑥正确；
⑦基因突变是不定向的，可能发生显性突变，也可以发生隐性突变，⑦正确；
⑧基因突变与染色体变异的重要区别在于基因突变在光镜下看不到，染色体变异在光学显微镜下能观察到，⑧正确．
故选：D．
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