微生物分为三类:非细胞型微生物、原核细胞型微生物、真核细胞型微生物非细胞型微生物:病毒原核细胞型微生物:细菌、支原体、立克次体、衣原体、螺旋体和放线菌真核细胞型微生物:细菌真菌细菌:金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠埃希菌、伤寒副伤寒沙门菌、军团菌、流感嗜血杆菌等真菌:白色念珠菌
凡是细胞核具有核膜、能进行有丝分裂、细胞质中存有线粒体或同时存在叶绿体等细胞器的微小生物,就称真核微生物,如:酵母菌、霉菌。