主要是传代次数上的差异。原代细胞一般指从动物组织直接提取的细胞，而细胞系是在原代培养的基础上经过传代和筛选得到。另外常用的细胞系，都是经过筛选得到的稳定细胞群体，特性在进行连续性实验时能够保证结果更加稳定，而原代细胞的优势则在于与机体细胞特征更加接近。
细胞系是不断生长,分化的细胞群,因其经过遗传改造,致使其具有无限增长的潜能.体外生长的细胞系用于医疗或科研.实际上,连续细胞系可以用大量次培养基 培养,随着代数的增加细胞的基因型和表型都有可能发生改变.
第一次收获和接种的细胞被称为原代细胞
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