是有区别的。
1、硬盘格式化是格式掉整个硬盘，完全清空，包括隐藏文件，冗余文件等。且可以改变格式化类型，如ntfs 或者fat32等。格式化后的磁盘无法还原。而直接删除文件则可以通过第3方软件还原（只要被删除的文件没有被新的文件覆盖）。
2、格式化是在磁盘中建立磁道和扇区，磁道和扇区建立好之后，电脑才可以使用磁盘来储存数据。删除是指将文件从系统的目录清单中删掉。
3、格式化硬盘后盘中所有文件将不复存在，而且需要重新做系统；删除硬盘里的所有东西如不做其他操作尚可找回文件或还原系统。
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