黑衣组织是一个神秘的跨国犯罪集团，虽然关于这个组织的全名/目的以及内部结构不是很清楚，但是可以知道的是在成立的这半个多世纪以来，一直在进行着各种犯罪活动，成员都是以酒名作为代号，而他们的主要目的之一就是研究药物，让人永葆青春，或者是让人死而复生！
该组织的首领是超级大富翁乌丸莲耶，不过目前关于他的相关消息并不是很多！只知道他特别特别的有钱！值得一提的是，在这位首领没有出现之前，很多的柯迷都认为大BOSS有可能是阿笠博士，直到17年12月青山亲自证实了乌丸莲耶的身份后，阿笠博士才彻底洗刷冤屈！
说完了首领，我们再来看看这个组织的嫌疑成员！
首先是琴酒和伏特加，这一对正是在第一集中给柯南下药的二人，伏特加做事不缜密，所以虽然跟伏特加看起来是搭档，但是真的行动起来却完全是人家的小弟！而琴酒，则是黑衣组织最重要的成员之一，冷酷无情，心思细腻！为了完成任务不择手动！但是对组织却极为忠诚，尤其是特别讨厌背叛者！一旦发现背叛者，便会倾尽所有也要彻底铲除他！
贝尔摩得
人称贝姐，黑衣组织中的颜值担当，在剧中美国的两位女明星都是由她一人扮演的！在组织中负责情报工作，擅长易容和变声！男人。女人老人。小孩，只有你想不到，没有贝姐模仿不到！是这个组织的神秘主义者，关于贝姐的立场一直是个谜，虽然她一直在为组织做事，但是另一方面，他知道柯南和灰原的真实身份，但是却没有报给组织！并且还非常希望柯南赶紧摧毁掉这个组织！
波本
真名安室透，是日本警察派到黑衣组织中的卧底，虽然表面上是个普通的咖啡店员，但是实际上，擅长分析于推理的他，跟贝姐一样都是负责收集情报！
基尔
真名位本堂瑛海，真实身份是CIA派到组织中的卧底，为了保护弟弟不被伤害，于是在FBI的协助下，再次进入到了组织中，向FBI提供情报！
基安蒂/科恩
这两人也是一对搭档，二人都是黑衣组织的狙击手，基安蒂左眼有蝴蝶纹身，经常画很重的眼影！而科恩则是平常带着一个帽子，沉默寡语，没有什么话！
目前的现役成员也就只有这些了，当然了，也有人脱离了组织！比如灰原和赤井秀一这两位就是组织曾经的成员，灰原的代号是雪莉，是开发药物的主要研究员，而赤井秀一则是非常擅长狙击工作！逃离的还有一位，那就是本来想要培养成杀手的沼渊己一郎，这个家伙因为杀人太多，被警方抓到后，立马处于死刑！
除了他俩之外，还有不少的人没等逃离，便已经死在组织的琴酒的枪声之下，比如灰原的姐姐以及父母，姐姐明美死在了琴酒的枪下，
而她的父母则是死在一场意外的火灾中，那这到底是事故还是人为的就不得而知了！
除了他们之外，还有因为拿错箱子而被杀掉的倒霉蛋龙舌兰，因为杀人时留下重要线索而被组织灭口的皮克斯！以及身份暴露的伊森本堂/诸伏景光！自杀的卡尔瓦多斯和楠田陆道。
《名侦探柯南》黑衣组织中其实也没几个卧底了，因为有很多都已经被解决掉了。现在已经确定是卧底的，并且还活着的目前只有三个人，分别是：
1.
赤井秀一。真实身份为美国FBI特工，化名“诸星大”而潜入组织进行卧底工作。曾经在组织里获得了很高的地位，并被授予了“莱伊”的代号。（黑衣组织里只有高级成员才会被授予代号）三年前因为一次抓捕行动中不慎身份暴露，只能被迫离开组织。
2.
本堂瑛海。真实身份为美国CIA特工，化名“水无玲奈”而潜入组织进行卧底工作，黑衣组织代号“基尔”。
3.
降谷零。真实身份为日本公安警察，化名“安室透”而潜入组织进行卧底工作，黑衣组织代号“波本”。关于他的描述，波本是一个很厉害的侦探，在组织里专门从事情报收集工作
目前已知：雪莉（灰原哀）、宫野明美、库拉索、爱尔兰、波本（降谷零）、基尔、伊森·本堂、黑麦威士忌、苏格兰威士忌
卧底有好多，安室透，水无怜奈，赤井秀一，司陶特，阿夸维特，雷司令，伊森本堂
还活着的人里面除了琴酒都是卧底，黑麦威士忌Rye是FBI检察官，波本Bourbon日本公安调查厅派入的，雪梨即灰原，脱离组织，并与之对抗。
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