牡丹江，发源于吉林省敦化市牡丹岭，由南向北流入黑龙江省，经宁安、牡丹江市、海林、林口，在依兰县城附近汇入松花江。
呼兰河，源出小兴安岭，上游克音河、努敏河等支流汇合后称呼兰河。西南流向，与来自北面的通肯河交汇后，改向南流，进入平原区，河道变宽，曲流发育，至呼兰县入松花江。
海拉尔河，源于大兴安岭西侧吉勒老奇山西坡，主流呈东向西流经牙克石与免渡河汇合，在海拉尔市区又接纳伊敏河，至乌固尔再纳入莫勒格尔河，在高原上流至阿巴盖图附近，主流转向北汇入额尔古纳河。
乌苏里江，发源于锡霍特山脉西南坡，向东北流到哈巴罗夫斯克（伯力）与黑龙江汇合。
挠力河，发源于完达山脉北坡，七台河市东南部。干流由西南流向东北，经七台河市、宝清县，于饶河县东安镇从左岸注入乌苏里江。
穆棱河，发源于老爷岭山脉东坡穆棱窝集岭，下游流经广袤平原，自西南流向东北，流经穆棱、鸡西、鸡东、密山、虎林五个市县，在虎头镇南注入乌苏里江。
松阿察河，发源于兴凯湖，自西南向东北流经密山市和虎林市，在虎林市东部八五八农场境内的泥口子处注入乌苏里江。
牡丹江主要支流珠尔多河、海浪河、五林河、乌斯浑河、三道河等也是基本由南向北流向汇入牡丹江。
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