防治方法：选用抗病品种；嫁接栽培是防治黄瓜枯萎病最有效途径。因枯萎病有黄瓜专化型，这个专化型主要侵染黄瓜、甜瓜等，不侵染南瓜，以南瓜做砧木与黄瓜嫁接的亲和力又好，也不改变黄瓜品质，还能增强黄瓜耐低温、干旱能力，秧体长势强，产量高，所以一般都用南瓜作砧木与黄瓜进行嫁接；比较有效的化学防治措施，是在发病前药剂灌根。定植后用500倍克枯星药剂灌根，7天～8天后再用菌毒清药液灌根，每次每株灌药500毫升左右，能收到较好的防治效果。用50%多菌灵500倍液，或50%甲基托布津可湿性粉剂400倍液灌根两次，也能收到一定的防治效果。
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