exec应该可以的，但是根据命令特征你可能需要结合使用sleep方法，例如：
exec('D:');
sleep(1);
exec('cd D:\\path\\path', $cmd); //反斜杠要转义哦
sleep(1);
if (! empty($cmd)) {
//$cmd 保存的是命令执行后的屏幕输出，针对cd这条命令，如果有输出肯定是错误信息
die($cmd);
}
exec('xelatex test.tex', $cmd);
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