根据九年义务治教育法的规定，孩子上学，必须是在父母和孩子的户口所在地就近入学。你说的这种情况，父母不在一起，孩子的户口在秦淮区，那么原则上应该在秦淮区最近的学校入学，但学校和教育局有人的话，去那上学都可以。只是高考时必须回户口所在地参加高考。
每个城市招生政策略有不同。 一般上小学的原则是就近入学。本市户口且在片区内有房产（写申请在房产处就近入学）应该没有问题。出现问题的原因可能是好学校名额报满或入学考试淘汰。 小升初是按学籍来划片派位的，只要是本市户口，与所在地无关。但如果户口片区中学不签字，也只能回户口片区就读初中。 不知道你小孩是上小学还是？户口与房产是否在同一个区？
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