个人建议：这要看企业的信息化建设程度，如果之前已经有较多的信息化系统的建设经验，在建设ERP系统并培训上线后，手工只是测试，测试几次校对后即可；如果之前信息化程度在初级阶段，则强烈建议并行一段时间比较好
看你是不是选择行业性的ERP，如果通用性的系统，可以考虑并行。
如果是定制开发的erp最好并行一段时间，如果是成熟产品，则需要对企业进行流程再造，可以完全按照操作流程进行，不需要并行。
