应纳税额=应发工资-个人缴纳社保-个人缴纳公积金-其他扣款。
个人缴纳社保，看你在哪个地区了，北京地区，个人缴纳社保比例如下：
养老保险8%，工伤保险，个人不缴纳公司缴纳，失业保险0.2%（农村户口不缴纳），医疗保险（含生育保险）2%+3元（大额医疗）。
因此，应该按照10000-（12586*10.2%+3）=8713元来缴纳个税。
个人所得税计算方法
征缴个人所得税的计算方法，个人所得税费用扣除标准原来是2000，十一届全国人大常委会第二十一次会议27日再次审议个人所得税法修正案草案，草案维持一审时“工资、薪金所得减除费用标准从2000元提高至3500元”的规定，同时将个人所得税第1级税率由5%修改为3%。使用超额累进税率的计算方法如下：
缴税=全月应纳税所得额*税率－速算扣除数
全月应纳税所得额=(应发工资－四金)－3500
实发工资=应发工资－四金－缴税
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