如果协议离婚,夫妻之间一人带一个就行,如果孩子小,在2岁以内是归母亲,十岁以上看孩子的意愿,你们好的情况是有两个孩子,一人带一个,如果法院判决离婚,孩子的归属大致也是这样,除非一方有不良嗜好及严重的传染病史,生活实在困难不愿意抚养孩子的,想这样法院就会判给另一方。
请问你们是协议离婚吗?协议书上若明确女儿归你,可向法院申请男方协助你迁户口。具体事情可找律师谈,女儿的事情可以处理好的。