部下还有几十万，后来被南明收编，最后被清军消灭。
李自成于弘光元年（1645年）五月战死于九宫山后，他的余部分为二支，一路由郝摇旗、袁宗第、李来亨等领导，活动在洞庭湖一带及湖北兴山地区；另一路由李过、高一功领导，活动在湘鄂赣地区。与明湖广总督何腾蛟、明湖北巡抚堵胤锡联合抗清。李自成余部得不到南明的信任，在经济上难以维持，后来逐渐被清军消灭。
