A、自然选择是定向的，决定了生物进化的方向，但生物的变异是不定向的，A错误；B、生物进化的实质是种群基因频率的定向改变，B错误；C、生殖隔离是新物种形成的标志，C正确；D、生物多样性包括基因多样性、物种多样性和生态系统多样性，D错误．故选：C．
