本科阶段来看，几乎没啥区别。分理论和应用两个方向，软件学院也有分方向，不过只是平台不同，都是软件应用方面的。所以数学课上，理论方向的学生上的是数分、高代，比较难，应用的和软件学院一样上高数、线代。计算机科学相对就有更数学、更学术的方向，比如去研究数理逻辑啊什么的，软件学院则更偏应用。另外，软件学院可能应该更偏应用，计算机系很多教授都是图像方向的，应用范围小。
