配置芯片用EPCS1，可以是AS模式，也可以通过jtag对EPCS Flash间接编程。一般多用第二种方法。
如果你用的是Quartus软件，首先用File菜单下的“Convert programming files”命令将SOF文件转换成利用JTAG口对EPCSx器件间接编程的文件。
然后下载转换后的文件。
AS模式下，是自己编译后生成的，一个。sof文件，另一个是pof文件。后者是用于AS模式编程的。
配置芯片采用EPCS1，可以是AS模式（cyclone手册里是这种方式接法），但是经过本人实验也可以像cyclonII器件一样采用JTAG间接配置。在采用quartusII软件情况下，只需将生成的.SOF文件转换为.jic文件，jtag下载时选择该文件下载即可。
quartus的编译选项在编译时会根据你的器件选择生成对应的文件格式。烧写时通过as口或者jtag口都可以
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