目前,银耳菌种的分离,常采用多孢子分离法、组织分离法和基内菌丝分离法3种。
(1)多孢子分离法
又称孢子弹射法。它是利用银耳子实层弹射有性孢子(担孢子)萌发成菌丝来获得纯白菌丝的一种方法。
(2)组织分离法
它是利用子实体的组织块或在银耳种瓶中挑取白毛团,移接到斜面培养基或木屑培养基上,培育成菌种的一种简便分离法。这种方法操作容易,继代能保持原菌株的优良种性,不易发生变异,被广泛采用。但如果选用的子实体感染病毒,分离得到的菌丝容易退化;若种耳耳片太老,菌丝成活率也很低。
(3)基内分离法
①在栽培袋群体中,选择标准种耳后,割去子实体,取菌袋内含有纯白菌丝体的耳基部位;②选取长有标准种耳的椴木,割去子实体,略烘干后从木质部分离纯白菌丝。这两种基质内获得的纯白菌丝移接斜面培养基中,在萌发的菌丝中进行提纯、转管培养。
上述3种方法均可获得纯菌种,目前生产上多采用组织分离法。