A、噬菌体作为实验材料的原因是成分只有蛋白质和DNA，而且注入的过程可以将蛋白质和DNA分离，进而单独的直接的观察各自的作用；A正确．
B、噬菌体是病毒，是营活细胞寄生生活的生物，不能直接在培养基上培养；B错误．
C、用搅拌、离心不是把DNA和蛋白质分离，而是将吸附在细菌外的噬菌体颗粒与细菌进行分离；C错误．
D、被感染的细菌（含有子代噬菌体的细菌）在下层的沉淀物中，噬菌体颗粒的质量较小，在上层的上清液中，细菌在沉淀物中，实验说明DNA是遗传物质，而不能是主要；D错误．
故本题选：A．
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