A、弃耕农田上的演替过程：草本阶段→灌木阶段→乔木阶段，所以农田弃耕后，在自然状态下首先很快就会长满小草，成为草丛，故A错误；
B、群落演替的根本原因在于群落内部，所以不遭受外界干扰因素时也会发生演替，故B错误；
C、基因库是指种群中全部个体的所有基因，13个岛屿上的鸟类可能不只有13个种群，所以种群基因库也不只有13个，故C错误；
D、随着群落演替的进行，植物类型逐渐增加，分层现象会更加明显，光能利用率提高，但能量传递效率不变，保持在10%～20%之间，故D正确．
故选：D．
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