鱼缸的过滤系统都差不多，一般没特殊要求。将抽水泵的吸水口和过滤槽的出水口分别放置在鱼缸的两边，使水形成回路，将鱼粪从到一边而被吸去。过滤槽依次放置过滤棉（丝袜更好用）、活性炭、珊瑚沙、生化棉等材料，以滤去鱼粪、繁殖硝化细菌等有益细菌。最好是采用植物过滤系统，就好似人家污水处理那样。
