可以喷洒1：1：200波尔多液，或用50%多菌灵1000倍液防治。
黄芩生长期间每年要追肥1-2次，追肥以复合肥效果最好，第一年于定苗后、第二年及以后于返青至封垄前进行一次土壤追肥，根据植株生长情况决定是否继续追肥。
黄芩播种后至出苗应保持土壤湿润，所以在播种和定植的时候要注意浇水，保证植株生长的水分要求，之后不遇特殊干旱可以不再浇水，雨季应多注意及时排水防涝。
黄芩种植为了提高产量应及时将花枝剪除，以减少养分消耗，促进根系生长，从而可以直接提高黄芩产量，在开花前就把花枝修剪掉。
黄芩出苗后至田间封垄要松土除草三四次，后视杂草生长等情况再中耕除草1-2次，黄芩生长快，所需养料也大，如果不及时除草会导致黄芩生长不良。
黄芩齐苗后对过密部位及时进行疏苗，防止植株强多养料徒长，按株距8厘米交错定苗，并对缺苗部位进行移栽补苗，要带土移栽，栽后及时浇水，这样有利于植株成活。
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