环境保护费改税后，缴纳方式由环保部门核定缴纳，改为纳税人自主申报缴纳。依照环保税法的规定，环保税按季申报缴纳，2018年4月1日至15日是环保税首个征期。
环境保护税按照污染物排放量折合的污染当量数计算缴纳，与其他税种的“查账征收”方式截然不同，专业技术要求高、计算过程比较复杂，必须依靠环保部门的专业技术力量协助税收征管。
“距首个申报期还有将近3个月，但各项征管准备工作已基本就绪。”蔡自力介绍，税务机关遵循“实用、管用、好用”的设计原则，优化纳税申报表设计，大幅度减轻了纳税人填报量。同时，依托金税三期工程系统提升网上办税服务水平，让纳税人多走“网路”、少跑马路。在环境保护税开征初期，将通过在办税服务厅增设申报专窗，建立纳税服务热线和环保服务热线协作机制，为纳税人提供及时、全面、准确的咨询服务，确保我国第一部绿色税法顺利实施，税制平稳转换。
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