while((len=in.read(buffer))!=-1)out.write(buffer,0,len)

这个数组的长度是1024节，in.read()是一次读一个字节。in.read(buffer)意思是一次读1024节。就像分段读一样。。。一次传进去一个1024长度的 buffer 而不是往buffer里边传。
第一次传了1024。第二次976。你可以建个短点字符串"abcde"下边代码试下
char[] buf = new char[3];
int len = 0;
while((len =fr.read(buf))!=-1) {
System.out.println(new String(buf,0,len));
}结果是 abc de;
int num = fr.read(buf);
//
// System.out.println(num+":"+new String(buf,0,num));
// int num1 = fr.read(buf);
// System.out.println(num1+":"+new String(buf,0,num1));
// int num2 = fr.read(buf);
你要这么写的话 第一次读的个数是3:abc 第二次 读的个数是2：de c第三次-1:dec 长度为3的数组 第一次够了 第二次 de顶掉了ab c保留；第三次 -1，没得读了 就还是dec

这个应该是如果文件大于1024字节，就一次读1024个字节，然后写出，写出后在读剩下的，依次循环输出，不会覆盖文件中的数据

应该自己做个实验，去验明。

如拷贝文件