我也遇到过类似问题，农村的新建房屋基本没有房产证，按法律上是违章建筑，但合乎农村的基本情况，只要你的手续齐全，有中人，有合同，就没问题。如果真像你所说，你就应该起诉，要求行政复议，如果手续不全，就麻烦了。
