程序分为主程序和子程序。
通常CNC是按主程序的指示运动的，如果主程序中遇有调用子程序的指令，则CNC按子程序运动，在子程序中遇到返回主程序的指令时，CNC便返回主程序继续执行。
（1）子程序的作用。某些被加工的零件中，常常会出现几何形状完全相同的加工轨迹，通常在几个程序中都会使用它，这个典型的加工程序段可以做成子程序。使用子程序可以减少不必要的重复编程，从而达到简化编程的目的。子程序可以在纸带或存储器方式下调出使用，即主程序可以调用子程序，一个子程序也可以调用下一级的子程序。子程序必须在主程序结束指令后建立，其作用相当于一个固定循环。
（2）子程序的格式与主程序相同。在子程序的开头，在地址O后写上子程序号，但在子程序的结尾需用M99指令（有些系统用RET返回），表示子程序结束、返回主程序。
（3）子程序的调用需放在主程序中，调用子程序的指令是一个程序段。
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