肯定是不合理的。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定，违法建筑在拆迁时不予补偿，但并不是无证房屋就一定是违法建筑。违法建筑是需要认定的，如果说符合规划和用地，建设也经过了审批，只是没有办证，这只是瑕疵，不能够完全按照无证房屋补偿。
没有房产证那就是无证房了。如果你之前已经履行了合法程序申请房产证但违法不批给你的，那另当别论，那是因为行政不作为导致的。
